Assim que Shoutarou Tatewaki conhece Sakurako Kujou, ele percebe que sua vida nunca mais será a mesma. Primeiro ele acredita que ela é responsável por um desaparecimento na vizinhança, mas logo descobre o verdadeiro talento dela: analisar ossos. Sakurako tem uma larga coleção de ossos de animais reconstruídos, mas ela deseja conseguir uma coleção de ossos humanos para a decepção de todos ao seu redor. Em pouco tempo, Shoutarou começa a seguir a osteologista nos muitos casos sem resolução que ela encontra – a maioria em forma de corpos em decomposição. Mas, com tantos incidentes ocorrendo ao redor deles, é possível haver um mistério ainda maior em suas vidas?